Trước khi thiết kế mộtbảng mạch nhiều lớp, cấu trúc của bảng mạch nhiều lớp được sử dụng phải được xác định dựa trên kích thước mạch, kích thước bảng mạch và yêu cầu về khả năng tương thích điện từ (EMC). Đó là quyết định nên sử dụng bảng mạch 4-lớp, lớp 6- hay cao hơn. Sau khi xác định được số lớp, nhà sản xuất bảng mạch nhiều lớp sẽ xác định vị trí sắp xếp của các lớp điện bên trong bảng mạch nhiều lớp và cách phân phối các tín hiệu khác nhau trên các lớp này. Đây là bài toán lựa chọn cấu trúc xếp chồng của nhà máy sản xuất bảng mạch nhiều lớp.
Các nguyên tắc chung để bố trí bảng mạch nhiều lớp được các nhà máy sản xuất bảng mạch nhiều lớp áp dụng là:
(1) Bên dưới bề mặt thiết bị (lớp thứ hai) là mặt phẳng nối đất, cung cấp lớp bảo vệ thiết bị và mặt phẳng tham chiếu cho hệ thống dây điện trên bề mặt thiết bị;
(2) Tất cả các lớp tín hiệu của bảng mạch nhiều lớp phải càng gần mặt phẳng đất càng tốt;
(3) Cố gắng tránh hai lớp tín hiệu liền kề nhau;
(4) Nguồn điện chính phải càng gần mặt đất tương ứng càng tốt;
(5) Về nguyên tắc, các nhà máy sản xuất bảng mạch nhiều lớp nên áp dụng thiết kế cấu trúc đối xứng. Ý nghĩa của sự đối xứng bao gồm: độ dày và loại lớp điện môi, độ dày của lá đồng và kiểu dáng.
(6) Tính đối xứng của các loại phân phối bảng mạch nhiều lớp (lớp lá đồng lớn, lớp mạch).
Khi thiết lập các lớp của bảng mạch nhiều lớp cụ thể, cần phải nắm bắt linh hoạt các nguyên tắc trên. Dựa trên sự hiểu biết các nguyên tắc trên, hãy xác định cách bố trí các lớp theo nhu cầu thực tế của bo mạch, chẳng hạn như lớp dây chính, nguồn điện, phân đoạn mặt đất, v.v., và tránh sao chép một cách máy móc.